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代谢组学常见问题与解答(环亚集团)

发布时间:2025-02-12   信息来源:樊茗眉

多维数据分析在生物医疗领域的重要性

在生物医疗研究中,数据分析方法如偏最小二乘法(PLS-DA)和正交偏最小二乘法(OPLS-DA)被广泛应用于模型构建和变量间关系分析。关于大样本的R²大于0.2的可接受性,这一标准依赖于具体的应用场景和研究领域。近年来,生物医学领域的数据复杂性和噪声水平普遍较高,因此R²大于0.2在某些情况下可能被接受。

代谢组学常见问题与解答(环亚集团)

然而,模型的优劣通常需结合Q²值(交叉验证决定系数)、预测性残差平方和(PRESS)以及模型的稳定性与可解释性来综合评估。较高的R²和Q²值、以及较低的PRESS值通常指示模型性能良好。对于OPLS-DA和PLS-DA的二维图,还需考虑主成分的贡献、变量负荷图及样本分布等因素,以全面评价模型的可靠性。

针对R²值的接受范围,建议参考与您研究领域相关的文献,以了解行业内的通常标准。对于相关研究,可以阅读以下文章以深入理解PLS-DA和OPLS-DA方法:

  • Trygg, J., & Wold, S. (2002). Orthogonal projections to latent structures (O-PLS). Journal of Chemometrics, 16(3), 119-128.
  • Bylesjö, M., et al. (2006). OPLS discriminant analysis: combining the strengths of PLS-DA and SIMCA classification. Journal of Chemometrics, 20(8-10), 341-351.
  • Eriksson, L., et al. (2008). CV-ANOVA for significance testing of PLS and OPLS® models. Journal of Chemometrics, 22(11-12), 594-600.
  • Worley, B., & Powers, R. (2013). Multivariate Analysis in Metabolomics. Current Metabolomics, 1(1), 92-107.

PLS分析中的载荷图解读

PLS分析的载荷图是理解潜变量与观测变量关系的关键工具。以下是如何分析载荷图的步骤:

  1. 观察坐标系:载荷图通常以二维坐标系表示,横坐标为潜变量的第一主成分,纵坐标为第二主成分。
  2. 识别观测变量:在坐标系中,观测变量以点或标签形式表示。
  3. 确定潜变量:潜变量以向量形式表现,向量之间的角度代表相关性。
  4. 分析观测变量关系:相邻观测变量表示较高相关性,而远离的变量则表示较低相关性。
  5. 计算载荷值:载荷值范围为-1到1,反映观测变量与潜变量的关系。
  6. 评估解释能力:载荷图的聚集程度能反映PLS模型的解释能力。

多糖结构分析技术

在多糖提取后的结构分析中,除了红外光谱(FT-IR),还有诸多技术可以使用。这些方法可以提供详细的单糖组成、连接方式和位置等信息:

不同的方法提供不同类型的信息,通常需结合多种技术以全面探究多糖的结构。

关于环亚集团的专业服务

强大的生物质谱分析服务是环亚集团的一大优势。作为医疗器械和生物制药领域的服务商,环亚集团致力于质量控制检测和项目验证。我们的实验室严格遵循国际标准,并通过了CNAS及ISO9001质量体系认证,为客户提供高质量的检测与分析服务。

我们的业务涵盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学等多个领域,已为3000多家企业和10000多位客户提供服务。我们期待为您的生物质谱分析需求提供优质方案和支持。